O Mestrado em Economia da Inovação e Empreendedorismo conta com a colaboração de cerca de 14 docentes, a maioria dos quais doutorados nas áreas da Economia ou da Gestão e pertencentes a centros de investigação classificados pela Fundação para a Ciência e Tecnologia com Muito Bom ou Excelente. Para além dos docentes da Faculdade de Economia, o mestrado conta também com a colaboração de docentes de outras instituições de ensino superior e de profissionais com grande experiência.